La ganaderia es una de las actividades pecuarias mas importantes para la economia colombiana, sin embargo su rentabilidad y competitividad se ven afectadas por las estrategias de seleccion implementadas actualmente, en la cuales se debe esperar hasta la edad adulta del animal para evaluar su desempeno productivo y reproductivo. Los programas de mejoramiento genetico implementados en las lecherias colombianas se han enfocado principalmente en la obtencion de mayores volumenes de produccion, y en los ultimos años en el mejoramiento de las caracteristicas de calidad de leche pero se ha dejado a un lado la eficiencia reproductiva de los animales afectando el rendimiento y la rentabilidad del sistema productivo. De esta manera se evidencia la necesidad de implementar nuevas tecnologias que permitan el mejoramiento de los sistemas de produccion, como la seleccion asistida por marcadores moleculares la cual optimiza el progreso genetico y aumenta la confiabilidad de los resultados. El objetivo de este trabajo es conocer las asociaciones alelicas y genotipicas del polimorfismo del exon 6 del gen POU1F1 con caracteristicas productivas, reproductivas y de calidad de leche para vacas Holstein en el departamento de Antioquia. Para esto se analizara la informacion productiva y reproductiva de 500 vacas Holstein pertenecientes a diferentes hatos del departamento de Antioquia. Estos individuos seran genotipificados con la tecnica PCR-RFLP. La asociacion del polimorfismo del gen POU1F1 con los parametros productivos, reproductivos y de calidad de leche se realizara mediante un modelo lineal mixto y se determinaran las frecuencias alelicas y genotipicas para evidenciar si se encuentran en equilibrio de Hardy-Weinberg. La diversidad genetica se evaluara comparando la proporcion de los diferentes genotipos dentro de las subpoblaciones mediante la heterocigosidad observada y la esperada. La estructura genetica se analizara mediante los estadisticos F de Wright. Con esta investigacion se espera determinar las variantes alelicas y genotipicas mas favorables para el mejoramiento de las caracteristicas de importancia economica mas evaluadas en los sistemas de produccion lecheros. Ademas se espera determinar la utilidad de este polimorfismo en los programas de seleccion asistida por marcadores moleculares que permitan mejorar la eficiencia y rentabilidad de los hatos ganaderos haciendolos mas competitivos a nivel nacional e internacional.