En este proyecto se pretende continuar con la linea de investigacion del Grupo de Biotecnologia microbiana enfocada en el desarrollo de herramientas moleculares y bioinformaticas para la caracterizacion de virus que afectan plantas de interes agricola en el pais. Dichos estudios se derivan de la utilizacion de metodologias de secuenciacion masiva de nueva generacion (NGS), que arroja una gran cantidad de informacion que actualmente debe ser analizada a traves del uso de diferentes herramientas bioinformaticas, cada una de las cuales se ejecuta de manera aislada, dificultandose asi el analisis global de los genomas o transcriptomas. En este trabajo se plantea el diseno, ejecucion y validacion de una plataforma que permita integrar las diferentes etapas del analisis de NGS, incluyendo los archivos de calidad, el ensamblaje, las busquedas en bases de datos moleculares, los analisis de abundancia relativa de virus y la anotacion de los genomas, especialmente aquella relacionada con los analisis de procesamiento postraduccional de poliproteinas virales. Ya que el grupo ha acumulado una base de informacion importante de diferentes transcriptomas de solanaceas infectadas con virus, incluyendo del tomate de mesa (Solanum lycopersicum), pimenton (Capsicum annum), papa (Solanum tuberosum y S. phureja) y uchuva (Physalis peruviana), la generacion de la plataforma planteada contara con datos reales de especies de importancia economica para el pais, lo que a su vez permitira generar una linea base de informacion sobre el estado fitosanitario viral de dichos cultivos. Se espera que los resultados obtenidos en este trabajo puedan ser utilizados para apoyar los programas de certificacion de semilla, estudios epidemiologicos y mejoramiento genetico que se adelantan en el pais con este grupo de solanaceas andinas.