El sistema biofloc ha sido implementado en la piscicultura por sus capacidades para disminuir el uso del suelo y la cantidad necesaria de agua, asi como el mejoramiento en la calidad de la misma por la remocion de compuestos nitrogenados. El objetivo de esta investigacion fue determinar la capacidad del almidon de yuca y del almidon de maiz en diferentes proporciones y relacion C:N en la estimulacion de la formacion de los floculos microbianos y mantenimiento de la calidad de agua en un sistema biofloc ex situ. Se evaluaron 2 fuentes de carbono (almidon de yuca y maiz) de forma independiente y en mezcla, y dos relaciones C:N (15:1 y 20:1), ademas de un grupo control (sin adicion de fuente de carbono C:N 8.1:1) para un total de 9 tratamientos, durante 30 dias. Cada unidad experimental contenia 18L de agua acuicola sintetica incluyendo alimento balanceado del 32% de proteina bruta. Se midieron diariamente los parametros de calidad de agua temperatura °C, oxigeno disuelto (mg/L), salinidad y el pH, mientras que cada 10 dias se midio el nitrogeno amoniacal total NAT (NH4 +, NH3), nitrito (NO2 -), nitrato (NO3 -); recuento de bacterias heterotrofas, volumen del floc ml/L (SS), solidos suspendidos totales (SST) alcalinidad y dureza total. Se realizo un ANOVA MR para las variables de calidad de agua, cuando fue necesario se completo con una prueba de medias de Tukey al nivel de probabilidad del 5% en el software SAS 9.2. Se observo disminucion del de NAT en todos los tratamientos, se encontro diferencias significativas (P < 0.05), la menor concentracion en el tratamiento Y20, mientras que el control y YM15 presentaron los valores mas altos. El recuento de bacterias heterotrofas, mostro un comportamiento ascendente hasta el dia 20, sin diferencia significativa (P >0.05) entre los tratamientos, indicando que la fuente de carbono aportada por el alimento fue suficiente para sustentar el crecimiento de las bacterias heterotrofas. Existio diferencias significativas (P <0.05) en el volumen del floc para el dia 20, encontrandose los mayores valores en el tratamiento Y20, seguido por MY20, el menor valor lo presento el grupo control, el hecho que las diferencias no continuaran hasta el dia 30 puede estar asociado a la disminucion de la frecuencia de la adicion de la fuente de carbono. Los SST fueron inferiores en el control siendo mayor en MY20.