Los hongos del genero Fusarium constituyen un grupo muy heterogeneo y dificil de clasificar. Sus especies pueden tener distribucion mundial o estar limitadas a habitats mas o menos especializados, donde actuan como saprofitos o parasitos. Algunas de sus especies son patogenos de plantas, causantes de enfermedades de gran importancia economica en cultivos agricolas. Varias de estas han cobrado mayor importancia al presente debido a su incremento paulatino como germenes patogenos para el hombre y animales. La capacidad patogenica de estos hongos oportunistas esta relacionada con la resistencia del hongo a antimicoticos, con el aumento de personas inmunosuprimidas y con condiciones ambientales favorables al hongo por lo que se prevee que su incidencia en humanos sea cada vez mayor (Nelson et al., 1994). En Colombia, el laboratorio de Micologia Medica de la Facultad de Medicina de la Universidad de Antioquia ha reportado un incremento anual del 211% de casos, entre 1990 y 2000 (Escobar y Carmona, 2003), y la Unidad de Micologia Medica y Experimental de la Corporacion para Investigaciones Biologicas (CIB) del 317% entre 1995 (29 aislamientos) y 2003 (92 aislamientos). Fusarium es actualmente uno de los hongos patogenos humanos mas comunes e importantes. La taxonomia de Fusarium se basa tradicionalmente en caracteres morfologicos, pero a nivel de especie muchos de estos caracteres presentan gran variacion y en laboratorio pueden alterarse por las condiciones de cultivo. La identificacion a nivel de especie es dificil y rara vez es reportada (Nelson et al., 1994). En Colombia, el diagnostico de la especie es infrecuente. La determinacion precisa de las especies de Fusarium es un prerrequisito para estudios de dispersion, infeccion y tratamiento del hospedero. Las tecnicas moleculares han permitido un gran avance en taxonomia de microorganismos. Las regiones del DNA ribosomal (DNAr) han sido muy utilizadas ya que son universales en los organismos vivos poseyendo partes altamente conservadas y otras variables que pueden ser caracteristicas de una especie. Estudios filogeneticos obtenidos por secuenciacion de regiones del DNAr de Fusarium han sido exitosos en la diferenciacion de especies (Hennequin et al., 1999; Mule et al., 1997; O’Donell et al., 1998; Summerbell and Schroers, 2002) y protocolos basados en la reaccion en cadena de la polimerasa (PCR) del DNAr han sido efectivos para la deteccion de algunas especies de Fusarium (Hue et al., 1999; Jaeger et al., 2000; Mishra et al., 2003; Yera et al., 2003). En este trabajo pretendemos identificar a nivel de especie por medio de la PCR del DNAr cepas de Fusarium patogenas para el hombre, las que fueron obtenidas de pacientes de la Unidad de Micologia Medica y Experimental de la Corporacion para Investigaciones Biologicas (CIB) en el periodo 2004-2005. La metodologia propuesta permitira obtener un protocolo economico, rapido y sencillo para la deteccion de especies de Fusarium, lo que permitiria un efectivo y oportuno tratamiento.