Las investigaciones en genetica de poblaciones de peces dulceacuicolas colombianos son desconocidas para especies de mediana importancia comerciala pesar de que muchas ellas se han clasificado en alguna categoria de riesgo. Debido a la carencia de herramientas que permitan desarrollar estudios genetico poblacionales en la especie vulnerable Leporinus muyscorum, este trabajo pretende desarrollar marcadores moleculares especie-especificos, utilizando tecnicas de secuenciacion de proxima generacion para realizar un analisis de estructura poblacional en el rio Cauca. Asi se generara informacion util con el fin de apoyar la seleccion de medidas de manejo y conservacion que contrarresten el impacto negativo de las actividades antropogenicas en la region.