Triportheus magdalenae Steindachner, 1878 es la unica especie presente en el oeste de la cordillera de los Andes y es endemica de Colombia y de la cuenca Magdalena-Cauca. En el pais, son escasas las publicaciones en la biologia de la especie y hasta ahora se desconocen sus aspectos geneticos y fenotipicos. En este trabajo se utilizo la morfometria geometrica como una herramienta con un alto soporte estadistico para diferenciar los morfotipos en esta especie, visualizar donde se localizan dichos cambios y comparar diferentes grupos presentes en la zona de muestreo. El estudio se hizo sobre el rio Cauca especificamente en la zona media y baja y se seleccionaron 325 fotografias de individuos sexualmente maduros recolectados alli. Posteriormente, se hizo un analisis generalizado de Procustes. Las diferencias en el tamano centroide entre sexos y tramos se estimaron con las pruebas no parametricas de Kruskall-Wallis y la prueba pareada de Mann-Whitney. Las diferencias en conformacion entre sexos y tramos se estimaron mediante un analisis de componentes principales (PCA) y se construyeron dendrogramas con el metodo UPGMA. Triportheus magdalenae presento un alto grado de variacion en la zona dorsal y en la zona ventral del cuerpo por lo que se encontro dimorfismo sexual en el tamano y en la conformacion. Ademas, se encontraron diferencias entre los individuos de los tramos evaluados en el area de estudio. Palabras claves: Triportheus magdalenae, variacion fenotipica, morfometria geometrica, rio Cauca.